W 1941 aresztowany przez Sowietów, a następnie zwolniony po zawarciu układu Sikorski-Majski. W 1944 przerzucony do kraju.
W latach 1944-45 dowódca AK. 19 stycznia 1945 wydał rozkaz o rozwiązaniu Armii Krajowej. W tym samym roku podstępnie aresztowany przez NKWD. W „Procesie szesnastu”skazany na 10 lat więzienia, zmarł w więzieniu w Moskwie.