Nauka

Nature: 30 tys. osób pozna swój genom do końca grudnia

Ostatnia aktualizacja: 07.12.2011 23:00
Do 30 tys. zwiększy się liczba osób, u których do końca 2011 r. zostanie zsekwencjowane DNA – prognozuje miesięcznik „Nature”. Pismo dodaje, że w ciągu kilku lat nawet kilku milionów będzie mogło poznać swój genom.
DNA 30 tys. osób zostanie rozszyfrowane do końca tego roku
Do 30 tys. zwiększy liczba osób, u których do końca 2011 r. zostanie zsekwencjowane DNA – prognozuje miesięcznik „Nature”. Pismo dodaje, że w ciągu kilku lat nawet kilku milionów będzie mogło poznać swój genom. 
 
Zmniejszają się koszty sekwencjonowania ludzkiego genomu, czyli odczytywania kolejności par nukleotydowych w cząsteczce DNA. „New York Times” pisze, że o ile w 2007 r. sięgały one 8,9 mln dol., to w lipcu 2011 r. spadły do zaledwie 10,5 tys. dol. za jeden genom.
Wkrótce sekwencjonowanie DNA będzie jeszcze tańsze. Dziennik prognozuje, że za rok, najpóźniej za dwa lata genom dowolnej osoby będzie można odczytać za 1 tys. dol. Za cztery lata cena ta spadnie do 800 dol.
Według Wikipedii, przełomowym wynalazkiem było wprowadzenie chipów DNA (mikromacierzy). Polegają one na tym, że na układ półprzewodnikowy nanosi się tysiące fragmentów kwasu deoksyrybonukleinowego. Jeżeli w badanej próbce znajdzie się kawałek DNA komplementarny do jednego z tych fragmentów, to odpowiadające mu pole na chipie zostanie aktywowane. Dzięki temu możliwe jest błyskawiczne określenie poziomu ekspresji zawartych w próbce genów.
Dziś znacznie trudniejsza, droższa i bardziej pracochłonna jest identyfikacja funkcjonalnych genów zawartych morzu informacji uzyskanych z sekwencjonowania.
E. Wirginia Armbrust z University of Washington powiedziała dziennikowi NJT, że o ile sekwencjonowanie DNA mikroorganizmów zabiera jedynie kilka tygodni, to analiza zgromadzonych danych trwa prawie dwa lata.
Wiele danych uzyskanych z sekwencjonowania DNA jest na Razie gromadzonych w pamięci komputerów w oczekiwaniu na nowe oprogramowanie, które w przyszłości pozwoli je wykorzystać.
Pierwszą sekwencję genomu ludzkiego na początku 2001 r. opublikowała firma Celera Genomics oraz konsorcjum HUGO. W 2003 r. ogłoszono zakończenie sekwencjonowania 99 proc. genomu z trafnością 99,99 proc.
Było to możliwe dzięki wprowadzaniu w latach osiemdziesiątych XX w. zautomatyzowanych metod sekwencjonowania DNA. Zajęły się tym tzw. roboty sekwencyjne, które zrewolucjonizowały badania nad materiałem genetycznym żywych organizmów.
Dziś coraz bliższa jest perspektywa zdobycia Nagroda Archon Genomics X PRIZE w wysokości 10 mln dolarów dla pierwszego ośrodka który będzie w stanie zsekwencjonować 100 genomów ludzkich w ciągu zaledwie 10 dni.

Zmniejszają się koszty sekwencjonowania ludzkiego genomu, czyli odczytywania kolejności par nukleotydowych w cząsteczce DNA. „New York Times” pisze, że o ile w 2007 roku sięgały one 8,9 mln dolarów, to w lipcu 2011 roku spadły do zaledwie 10,5 tys. dol. za jeden genom.

Wkrótce sekwencjonowanie DNA będzie jeszcze tańsze. Dziennik prognozuje, że za rok, najpóźniej za dwa lata genom dowolnej osoby będzie można odczytać za 1 tys. dolarów. Za cztery lata cena ta spadnie do 800 dolarów.

Według Wikipedii, przełomowym wynalazkiem było wprowadzenie chipów DNA (mikromacierzy). Polegają one na tym, że na układ półprzewodnikowy nanosi się tysiące fragmentów kwasu deoksyrybonukleinowego. Jeżeli w badanej próbce znajdzie się kawałek DNA komplementarny do jednego z tych fragmentów, to odpowiadające mu pole na chipie zostanie aktywowane. Dzięki temu możliwe jest błyskawiczne określenie poziomu ekspresji zawartych w próbce genów.

Dziś znacznie trudniejsza, droższa i bardziej pracochłonna jest identyfikacja funkcjonalnych genów zawartych morzu informacji uzyskanych z sekwencjonowania.

E. Wirginia Armbrust z University of Washington powiedziała dziennikowi NYT, że o ile sekwencjonowanie DNA mikroorganizmów zabiera jedynie kilka tygodni, to analiza zgromadzonych danych trwa prawie dwa lata.

Wiele danych uzyskanych z sekwencjonowania DNA jest na razie gromadzonych w pamięci komputerów w oczekiwaniu na nowe oprogramowanie, które w przyszłości pozwoli je wykorzystać.

Pierwsza dekada za nami

Pierwszą sekwencję genomu ludzkiego na początku 2001 roku opublikowała firma Celera Genomics oraz konsorcjum HUGO. W 2003 roku ogłoszono zakończenie sekwencjonowania 99 proc. genomu z trafnością 99,99 proc.
Było to możliwe dzięki wprowadzaniu w latach 80. XX wieku zautomatyzowanych metod sekwencjonowania DNA. Zajęły się tym tzw. roboty sekwencyjne, które zrewolucjonizowały badania nad materiałem genetycznym żywych organizmów.

Dziś coraz bliższa jest perspektywa zdobycia Nagroda Archon Genomics X PRIZE w wysokości 10 mln dolarów dla pierwszego ośrodka który będzie w stanie zsekwencjonować 100 genomów ludzkich w ciągu zaledwie 10 dni.

(ew/pap)

Zobacz więcej na temat: DNA firma komputery
Czytaj także

Wszyscy jesteśmy mutantami

Ostatnia aktualizacja: 24.06.2011 11:00
Kiedy rodzice przekazują nam geny, pojawia się średnio 60 błędów. Każdy z nas nosi w sobie mniej więcej tyle genetycznych mutacji, wynika z najnowszych badań. A zatem wszyscy, z genetycznego punktu widzenia, jesteśmy zmodyfikowani.
rozwiń zwiń
Czytaj także

Skomplikowane wnętrze kartofla

Ostatnia aktualizacja: 14.07.2011 11:45
Kartofel tylko z pozoru jest nieciekawy. Dzięki naukowcom z czterech kontynentów - w tym także z polskiego Instytutu Biochemii i Biofizyki PAN - udało się poznać 1/4 genomu ziemniaka - informuje "Nature".
rozwiń zwiń
Czytaj także

Co wyssaliśmy z mlekiem matki?

Ostatnia aktualizacja: 02.08.2011 11:50
W Czwórce, przy okazji Tygodnia karmienia piersią, rozmawiamy o dziedziczeniu, genetyce i cechach, które możemy otrzymać od naszych rodziców.
rozwiń zwiń
Czytaj także

Polacy zsekwencjonowali genom ogórka

Ostatnia aktualizacja: 06.09.2011 08:40
Zespół prof. Zbigniewa Przybeckiego ze Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego Warszawie zsekwencjonowali genom ogórka północnoeuropejskiego. To nie jedyne osiągnięcie naukowców z SGGW.
rozwiń zwiń