Nauka

USB, które zbada DNA

Ostatnia aktualizacja: 22.02.2012 12:15
Urządzenie wyglądające jak popularna pamięć masowa po podłączeniu do laptopa potrafi zbadać DNA w ciągu sekund - informuje "New Scientist".
USB, które zbada DNA
Foto: sxc.hu.

Zbudowany przez brytyjską firmę Oxford Nanopore MiniION radzi sobie z zsekwencjonowaniem genomu bakterii czy wirusa w ciągu niewielu sekund. Większe genomy wymagają więcej czasu, ale MiniION może również posłużyć do badań próbki komórek podejrzanych o cechy nowotworowe bądź do identyfikacji genetycznej tożsamości zwłok.

Podczas demonstracji - w czasie konferencji Advances in Genome Biology and Technology na Florydzie - udało się zsekwencjonować prostego wirusa PhiX, którego genom składa się z 5000 par zasad. Tego akurat wirusa wybrano, ponieważ jego genom był pierwszym genomem, jaki kiedykolwiek udało się zsekwencjonować.

Oxford Nanopore wyprodukowała także większe urządzenie o nazwie GridION odo użytku laboratoryjnego. Działa na tej samej zasadzie, co jak MiniION - DNA wprowadzane jest do roztworu zawierającego enzymy, które przyczepiają się do końca każdej z nici. Następnie pod wpływem prądu elektrycznego enzymy i DNA trafiają do setek otworów w membranie na dnie roztworu.

Każdy otwór ma tylko 10 mikrometrów średnicy i umieszczono w nim zmodyfikowaną wersję białka alfa-hemolizyny (AHL), w którego centrum jest pusta, rurkowata przestrzeń o średnicy 10 nanometrów. Gdy DNA wciągane jest do tego otworu, enzym łączy się z AHL i rozdziela dwie nici DNA, przy czym jedna z oddzielonych nici jest wciągana do otworu. Wyjątkowe właściwości elektryczne każdej z zasad zakłócają przepływ prądu przez poszczególne otwory membrany w sposób, który umożliwia ich identyfikację.

Metoda ma dwie ogromne zalety - po pierwsze, nie trzeba powielać DNA, by uzyskać odpowiednią jego ilość, po drugie zaś - można odczytywać fragmenty DNA liczące do 10 000 jednostek, podczas gdy inne techniki wymagają pocięcia tegoż DNA na krótsze odcinki. Czytnik ma trafić do sprzedaży w tym roku, w cenie 900 dolarów - przystępnej dla większości lekarzy.

(ew/pap)

Czytaj także

Wrażenia zapachowe do gier. Poczuj zapach swojego komputera

Ostatnia aktualizacja: 24.02.2011 15:04
Kiedyś mówiło się pół żartem, pół serio, że telewizję i gry będzie można smakować i wąchać. Dzięki wynalazkowi amerykańskiej firmy może spełnić się przynajmniej drugą z przepowiedni.
rozwiń zwiń
Czytaj także

Lubisz spać? Mogłeś to odziedziczyć

Ostatnia aktualizacja: 08.12.2011 00:10
Osoby, które lubią sobie pospać mogą mieć do tego genetyczne predyspozycje - informuje pismo " Molecular Psychiatry".
rozwiń zwiń
Czytaj także

Nature: 30 tys. osób pozna swój genom do końca grudnia

Ostatnia aktualizacja: 07.12.2011 23:00
Do 30 tys. zwiększy się liczba osób, u których do końca 2011 r. zostanie zsekwencjowane DNA – prognozuje miesięcznik „Nature”. Pismo dodaje, że w ciągu kilku lat nawet kilku milionów będzie mogło poznać swój genom.
rozwiń zwiń
Czytaj także

Ulubione perfumy zapisane w Twoim DNA

Ostatnia aktualizacja: 03.01.2012 11:00
Dlaczego zapach, który uważamy za piękny, innym wydaje się odpychający? Odpowiedź tkwi w naszych genach - odpowiadają naukowcy, których artykuł ukazał się w "International Journal of Cosmetic Science".
rozwiń zwiń
Czytaj także

Cząsteczka, która wplątuje się w DNA

Ostatnia aktualizacja: 20.02.2012 13:00
Nawet na 16 dni potrafi zablokować DNA cząsteczka odkryta przez naukowców z University of Texas w Austin (USA) - informuje "Nature Chemistry".
rozwiń zwiń